La colección está formada por unas 7.000 cartas, la mayoría manuscritas y de los siglos XVIII y XIX, y 230 atlas, tanto españoles como europeos, que constituyen un fondo inapreciable para estudiar la historia marítima y geográfica de estos siglos.
Ámbito geográfico:
- Documentos de las antiguas colonias americanas y de Filipinas. Es el fondo más importante, casi todo cartas náuticas, aunque también hay mapas y planos del interior del continente americano.
- Cartas náuticas de las costas de España y de las antiguas posesiones de África.
- Cartografía de la costa atlántica europea.
- Cartografía del Mediterráneo.
Parte de los fondos de esta colección cartográfica (16.612 registros catalográficos) están recogidos en el Catálogo Colectivo Documental de Defensa, en la base de datos de Cartografía Histórica.
La base de datos de Cartografía Histórica contiene en la actualidad más de 78.000 registros catalográficos de tres centros depositarios: el Archivo General Militar de Madrid, el Centro Geográfico del Ejército y el Museo Naval; puede consultarse desde cualquier Archivo o Biblioteca conectada a la intranet del Ministerio de Defensa y próximamente también desde Internet.